Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FLOT1O75955 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FLOT1O75955 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
FLOT1O75955 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FLOT1O75955 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FLOT1O75955 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
FLOT1O75955 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FLOT1O75955 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FLOT1O75955 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FLOT1O75955 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FLOT1O75955 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FLOT1O75955 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FLOT1O75955 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FLOT1O75955 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FLOT1O75955 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FLOT1O75955 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FLOT1O75955 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FLOT1O75955 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FLOT1O75955 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FLOT1O75955 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FLOT1O75955 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FLOT1O75955 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FLOT1O75955 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FLOT1O75955 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FLOT1O75955 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FLOT1O75955 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FLOT1O75955 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FLOT1O75955 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FLOT1O75955 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FLOT1O75955 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FLOT1O75955 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FLOT1O75955 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FLOT1O75955 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FLOT1O75955 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FLOT1O75955 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FLOT1O75955 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FLOT1O75955 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FLOT1O75955 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FLOT1O75955 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms