Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASSF9O75901 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASSF9O75901 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASSF9O75901 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASSF9O75901 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASSF9O75901 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RASSF9O75901 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RASSF9O75901 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RASSF9O75901 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RASSF9O75901 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RASSF9O75901 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RASSF9O75901 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RASSF9O75901 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RASSF9O75901 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RASSF9O75901 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASSF9O75901 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RASSF9O75901 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASSF9O75901 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASSF9O75901 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms