Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBBP9O75884 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP9O75884 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RBBP9O75884 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP9O75884 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms