Protein–RNA interactions for Protein: O75844

ZMPSTE24, CAAX prenyl protease 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMPSTE24O75844 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZMPSTE24O75844 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZMPSTE24O75844 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZMPSTE24O75844 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMPSTE24O75844 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMPSTE24O75844 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMPSTE24O75844 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMPSTE24O75844 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZMPSTE24O75844 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZMPSTE24O75844 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZMPSTE24O75844 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZMPSTE24O75844 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZMPSTE24O75844 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZMPSTE24O75844 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZMPSTE24O75844 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZMPSTE24O75844 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZMPSTE24O75844 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZMPSTE24O75844 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMPSTE24O75844 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMPSTE24O75844 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMPSTE24O75844 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMPSTE24O75844 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMPSTE24O75844 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMPSTE24O75844 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMPSTE24O75844 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMPSTE24O75844 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMPSTE24O75844 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMPSTE24O75844 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMPSTE24O75844 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMPSTE24O75844 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMPSTE24O75844 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZMPSTE24O75844 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMPSTE24O75844 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZMPSTE24O75844 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZMPSTE24O75844 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZMPSTE24O75844 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMPSTE24O75844 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZMPSTE24O75844 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZMPSTE24O75844 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZMPSTE24O75844 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZMPSTE24O75844 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZMPSTE24O75844 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZMPSTE24O75844 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZMPSTE24O75844 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZMPSTE24O75844 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZMPSTE24O75844 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms