Protein–RNA interactions for Protein: O75679

RFPL3, Ret finger protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL3O75679 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFPL3O75679 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFPL3O75679 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFPL3O75679 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms