Protein–RNA interactions for Protein: O75387

SLC43A1, Large neutral amino acids transporter small subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A1O75387 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC43A1O75387 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC43A1O75387 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC43A1O75387 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC43A1O75387 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms