Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX3O75364 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX3O75364 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX3O75364 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX3O75364 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX3O75364 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX3O75364 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX3O75364 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX3O75364 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX3O75364 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX3O75364 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX3O75364 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX3O75364 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX3O75364 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX3O75364 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITX3O75364 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITX3O75364 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITX3O75364 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITX3O75364 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITX3O75364 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITX3O75364 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX3O75364 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX3O75364 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX3O75364 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX3O75364 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX3O75364 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX3O75364 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX3O75364 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITX3O75364 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITX3O75364 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITX3O75364 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITX3O75364 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITX3O75364 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITX3O75364 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITX3O75364 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITX3O75364 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITX3O75364 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITX3O75364 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PITX3O75364 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITX3O75364 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITX3O75364 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PITX3O75364 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PITX3O75364 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITX3O75364 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITX3O75364 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITX3O75364 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITX3O75364 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PITX3O75364 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITX3O75364 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PITX3O75364 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PITX3O75364 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX3O75364 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX3O75364 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX3O75364 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX3O75364 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX3O75364 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX3O75364 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX3O75364 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITX3O75364 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX3O75364 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX3O75364 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX3O75364 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX3O75364 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX3O75364 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX3O75364 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX3O75364 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX3O75364 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITX3O75364 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITX3O75364 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PITX3O75364 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITX3O75364 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITX3O75364 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITX3O75364 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITX3O75364 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITX3O75364 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PITX3O75364 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITX3O75364 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITX3O75364 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITX3O75364 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITX3O75364 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITX3O75364 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITX3O75364 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITX3O75364 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITX3O75364 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITX3O75364 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PITX3O75364 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITX3O75364 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITX3O75364 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITX3O75364 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITX3O75364 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITX3O75364 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITX3O75364 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITX3O75364 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITX3O75364 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITX3O75364 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX3O75364 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX3O75364 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX3O75364 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX3O75364 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX3O75364 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms