Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EIF5BO60841 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EIF5BO60841 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EIF5BO60841 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
EIF5BO60841 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
EIF5BO60841 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
EIF5BO60841 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
EIF5BO60841 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
EIF5BO60841 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EIF5BO60841 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
EIF5BO60841 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EIF5BO60841 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EIF5BO60841 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EIF5BO60841 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EIF5BO60841 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EIF5BO60841 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
EIF5BO60841 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EIF5BO60841 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EIF5BO60841 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EIF5BO60841 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EIF5BO60841 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EIF5BO60841 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EIF5BO60841 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
EIF5BO60841 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
EIF5BO60841 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
EIF5BO60841 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
EIF5BO60841 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
EIF5BO60841 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
EIF5BO60841 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
EIF5BO60841 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
EIF5BO60841 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EIF5BO60841 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EIF5BO60841 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
EIF5BO60841 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EIF5BO60841 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EIF5BO60841 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EIF5BO60841 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EIF5BO60841 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EIF5BO60841 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EIF5BO60841 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EIF5BO60841 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EIF5BO60841 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EIF5BO60841 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EIF5BO60841 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EIF5BO60841 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EIF5BO60841 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EIF5BO60841 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EIF5BO60841 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms