Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF2O60811 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF2O60811 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF2O60811 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF2O60811 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms