Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DHX16O60231 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DHX16O60231 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DHX16O60231 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DHX16O60231 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DHX16O60231 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DHX16O60231 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DHX16O60231 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DHX16O60231 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DHX16O60231 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DHX16O60231 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DHX16O60231 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DHX16O60231 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DHX16O60231 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DHX16O60231 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DHX16O60231 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
DHX16O60231 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DHX16O60231 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DHX16O60231 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DHX16O60231 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DHX16O60231 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DHX16O60231 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DHX16O60231 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DHX16O60231 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
DHX16O60231 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DHX16O60231 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DHX16O60231 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DHX16O60231 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DHX16O60231 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DHX16O60231 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DHX16O60231 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DHX16O60231 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DHX16O60231 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DHX16O60231 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
DHX16O60231 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DHX16O60231 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DHX16O60231 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DHX16O60231 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DHX16O60231 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DHX16O60231 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DHX16O60231 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DHX16O60231 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DHX16O60231 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DHX16O60231 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DHX16O60231 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DHX16O60231 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DHX16O60231 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DHX16O60231 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DHX16O60231 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DHX16O60231 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DHX16O60231 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DHX16O60231 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DHX16O60231 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DHX16O60231 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DHX16O60231 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DHX16O60231 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DHX16O60231 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DHX16O60231 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DHX16O60231 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DHX16O60231 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DHX16O60231 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DHX16O60231 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DHX16O60231 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DHX16O60231 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DHX16O60231 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DHX16O60231 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DHX16O60231 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DHX16O60231 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DHX16O60231 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DHX16O60231 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DHX16O60231 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DHX16O60231 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX16O60231 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX16O60231 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX16O60231 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX16O60231 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX16O60231 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX16O60231 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DHX16O60231 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX16O60231 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DHX16O60231 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX16O60231 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX16O60231 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX16O60231 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX16O60231 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX16O60231 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX16O60231 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX16O60231 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DHX16O60231 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
DHX16O60231 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX16O60231 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX16O60231 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX16O60231 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX16O60231 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX16O60231 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DHX16O60231 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DHX16O60231 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DHX16O60231 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DHX16O60231 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DHX16O60231 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms