Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGTAO43765 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGTAO43765 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGTAO43765 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SGTAO43765 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGTAO43765 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGTAO43765 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGTAO43765 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGTAO43765 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGTAO43765 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SGTAO43765 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGTAO43765 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGTAO43765 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SGTAO43765 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGTAO43765 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SGTAO43765 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGTAO43765 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGTAO43765 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGTAO43765 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGTAO43765 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGTAO43765 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGTAO43765 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGTAO43765 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGTAO43765 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGTAO43765 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGTAO43765 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGTAO43765 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGTAO43765 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGTAO43765 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGTAO43765 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGTAO43765 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGTAO43765 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SGTAO43765 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGTAO43765 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGTAO43765 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGTAO43765 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGTAO43765 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGTAO43765 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SGTAO43765 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGTAO43765 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGTAO43765 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SGTAO43765 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGTAO43765 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGTAO43765 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGTAO43765 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGTAO43765 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGTAO43765 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGTAO43765 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SGTAO43765 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGTAO43765 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGTAO43765 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGTAO43765 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGTAO43765 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGTAO43765 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SGTAO43765 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SGTAO43765 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGTAO43765 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGTAO43765 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGTAO43765 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGTAO43765 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGTAO43765 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SGTAO43765 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGTAO43765 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGTAO43765 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGTAO43765 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGTAO43765 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGTAO43765 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGTAO43765 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGTAO43765 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGTAO43765 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGTAO43765 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGTAO43765 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGTAO43765 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGTAO43765 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGTAO43765 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SGTAO43765 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGTAO43765 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGTAO43765 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGTAO43765 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGTAO43765 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGTAO43765 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGTAO43765 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGTAO43765 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGTAO43765 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SGTAO43765 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SGTAO43765 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SGTAO43765 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SGTAO43765 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGTAO43765 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGTAO43765 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGTAO43765 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGTAO43765 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGTAO43765 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGTAO43765 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGTAO43765 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGTAO43765 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGTAO43765 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGTAO43765 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGTAO43765 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SGTAO43765 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms