Protein–RNA interactions for Protein: O43747

AP1G1, AP-1 complex subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1G1O43747 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1G1O43747 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1G1O43747 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP1G1O43747 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AP1G1O43747 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP1G1O43747 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP1G1O43747 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP1G1O43747 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP1G1O43747 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP1G1O43747 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP1G1O43747 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms