Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPRY3O43610 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRY3O43610 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRY3O43610 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRY3O43610 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRY3O43610 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRY3O43610 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRY3O43610 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRY3O43610 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPRY3O43610 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SPRY3O43610 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPRY3O43610 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPRY3O43610 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPRY3O43610 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPRY3O43610 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPRY3O43610 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRY3O43610 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRY3O43610 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRY3O43610 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRY3O43610 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRY3O43610 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRY3O43610 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRY3O43610 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPRY3O43610 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SPRY3O43610 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPRY3O43610 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SPRY3O43610 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPRY3O43610 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms