Protein–RNA interactions for Protein: O43504

LAMTOR5, Ragulator complex protein LAMTOR5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR5O43504 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMTOR5O43504 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMTOR5O43504 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMTOR5O43504 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMTOR5O43504 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMTOR5O43504 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMTOR5O43504 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMTOR5O43504 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMTOR5O43504 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMTOR5O43504 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMTOR5O43504 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMTOR5O43504 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMTOR5O43504 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMTOR5O43504 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMTOR5O43504 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMTOR5O43504 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMTOR5O43504 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMTOR5O43504 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMTOR5O43504 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMTOR5O43504 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMTOR5O43504 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMTOR5O43504 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMTOR5O43504 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMTOR5O43504 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMTOR5O43504 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMTOR5O43504 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMTOR5O43504 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMTOR5O43504 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMTOR5O43504 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMTOR5O43504 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMTOR5O43504 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMTOR5O43504 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMTOR5O43504 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMTOR5O43504 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMTOR5O43504 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMTOR5O43504 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms