Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF208O43345 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF208O43345 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF208O43345 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms