Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTSS1O43312 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTSS1O43312 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MTSS1O43312 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTSS1O43312 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTSS1O43312 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTSS1O43312 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTSS1O43312 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTSS1O43312 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MTSS1O43312 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTSS1O43312 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTSS1O43312 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTSS1O43312 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTSS1O43312 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTSS1O43312 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTSS1O43312 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTSS1O43312 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTSS1O43312 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MTSS1O43312 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTSS1O43312 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTSS1O43312 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTSS1O43312 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTSS1O43312 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTSS1O43312 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTSS1O43312 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTSS1O43312 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTSS1O43312 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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