Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD3O43242 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMD3O43242 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD3O43242 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD3O43242 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMD3O43242 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD3O43242 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD3O43242 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD3O43242 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD3O43242 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD3O43242 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD3O43242 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD3O43242 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD3O43242 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD3O43242 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD3O43242 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD3O43242 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD3O43242 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD3O43242 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD3O43242 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD3O43242 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSMD3O43242 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms