Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHGDHO43175 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHGDHO43175 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHGDHO43175 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms