Protein–RNA interactions for Protein: O15522

NKX2-8, Homeobox protein Nkx-2.8, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-8O15522 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX2-8O15522 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKX2-8O15522 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKX2-8O15522 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-8O15522 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKX2-8O15522 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-8O15522 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-8O15522 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-8O15522 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-8O15522 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-8O15522 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NKX2-8O15522 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms