Protein–RNA interactions for Protein: O15194

CTDSPL, CTD small phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPLO15194 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSPLO15194 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPLO15194 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSPLO15194 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms