Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR1CO15160 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1CO15160 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1CO15160 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1CO15160 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms