Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
SYNJ2O15056 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
SYNJ2O15056 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
SYNJ2O15056 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
SYNJ2O15056 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
SYNJ2O15056 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
SYNJ2O15056 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
SYNJ2O15056 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
SYNJ2O15056 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
SYNJ2O15056 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC41.38■■■■■ 4.21
SYNJ2O15056 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
SYNJ2O15056 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
SYNJ2O15056 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
SYNJ2O15056 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
SYNJ2O15056 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
SYNJ2O15056 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
SYNJ2O15056 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
SYNJ2O15056 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
SYNJ2O15056 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
SYNJ2O15056 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
SYNJ2O15056 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
SYNJ2O15056 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
SYNJ2O15056 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
SYNJ2O15056 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
SYNJ2O15056 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
SYNJ2O15056 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC41.32■■■■■ 4.2
SYNJ2O15056 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
SYNJ2O15056 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC41.31■■■■■ 4.2
SYNJ2O15056 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SYNJ2O15056 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SYNJ2O15056 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
SYNJ2O15056 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
SYNJ2O15056 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
SYNJ2O15056 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
SYNJ2O15056 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
SYNJ2O15056 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
SYNJ2O15056 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
SYNJ2O15056 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC41.24■■■■■ 4.19
SYNJ2O15056 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
SYNJ2O15056 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
SYNJ2O15056 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SYNJ2O15056 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
SYNJ2O15056 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
SYNJ2O15056 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
SYNJ2O15056 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
SYNJ2O15056 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
SYNJ2O15056 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
SYNJ2O15056 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
SYNJ2O15056 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
SYNJ2O15056 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
SYNJ2O15056 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
SYNJ2O15056 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
SYNJ2O15056 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
SYNJ2O15056 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
SYNJ2O15056 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
SYNJ2O15056 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
SYNJ2O15056 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
SYNJ2O15056 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
SYNJ2O15056 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
SYNJ2O15056 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
SYNJ2O15056 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
SYNJ2O15056 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
SYNJ2O15056 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
SYNJ2O15056 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
SYNJ2O15056 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
SYNJ2O15056 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
SYNJ2O15056 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
SYNJ2O15056 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
SYNJ2O15056 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
SYNJ2O15056 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
SYNJ2O15056 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
SYNJ2O15056 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SYNJ2O15056 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SYNJ2O15056 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SYNJ2O15056 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SYNJ2O15056 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms