Protein–RNA interactions for Protein: O15027

SEC16A, Protein transport protein Sec16A, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16AO15027 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC16AO15027 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC16AO15027 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC16AO15027 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC16AO15027 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC16AO15027 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC16AO15027 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC16AO15027 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC16AO15027 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC16AO15027 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC16AO15027 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC16AO15027 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC16AO15027 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC16AO15027 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC16AO15027 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC16AO15027 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC16AO15027 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC16AO15027 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC16AO15027 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC16AO15027 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC16AO15027 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC16AO15027 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEC16AO15027 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC16AO15027 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC16AO15027 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC16AO15027 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.7 ms