Protein–RNA interactions for Protein: O14965

AURKA, Aurora kinase A, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AURKAO14965 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
AURKAO14965 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AURKAO14965 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AURKAO14965 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AURKAO14965 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AURKAO14965 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AURKAO14965 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AURKAO14965 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AURKAO14965 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AURKAO14965 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AURKAO14965 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AURKAO14965 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AURKAO14965 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AURKAO14965 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AURKAO14965 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AURKAO14965 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AURKAO14965 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AURKAO14965 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AURKAO14965 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AURKAO14965 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AURKAO14965 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AURKAO14965 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AURKAO14965 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AURKAO14965 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AURKAO14965 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AURKAO14965 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AURKAO14965 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AURKAO14965 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AURKAO14965 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AURKAO14965 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AURKAO14965 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AURKAO14965 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AURKAO14965 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AURKAO14965 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AURKAO14965 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AURKAO14965 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AURKAO14965 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AURKAO14965 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AURKAO14965 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AURKAO14965 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AURKAO14965 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AURKAO14965 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AURKAO14965 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AURKAO14965 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AURKAO14965 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AURKAO14965 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AURKAO14965 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AURKAO14965 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AURKAO14965 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AURKAO14965 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AURKAO14965 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AURKAO14965 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AURKAO14965 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AURKAO14965 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AURKAO14965 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AURKAO14965 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AURKAO14965 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AURKAO14965 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AURKAO14965 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
AURKAO14965 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AURKAO14965 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AURKAO14965 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AURKAO14965 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AURKAO14965 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AURKAO14965 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AURKAO14965 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AURKAO14965 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AURKAO14965 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AURKAO14965 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AURKAO14965 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AURKAO14965 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AURKAO14965 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AURKAO14965 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AURKAO14965 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AURKAO14965 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AURKAO14965 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AURKAO14965 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AURKAO14965 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AURKAO14965 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AURKAO14965 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AURKAO14965 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AURKAO14965 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AURKAO14965 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AURKAO14965 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AURKAO14965 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AURKAO14965 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AURKAO14965 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AURKAO14965 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AURKAO14965 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AURKAO14965 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AURKAO14965 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AURKAO14965 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AURKAO14965 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AURKAO14965 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AURKAO14965 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AURKAO14965 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AURKAO14965 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AURKAO14965 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AURKAO14965 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AURKAO14965 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms