Protein–RNA interactions for Protein: O00767

SCD, Acyl-CoA desaturase, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCDO00767 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCDO00767 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCDO00767 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCDO00767 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCDO00767 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCDO00767 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCDO00767 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCDO00767 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCDO00767 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCDO00767 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCDO00767 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCDO00767 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCDO00767 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCDO00767 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCDO00767 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCDO00767 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCDO00767 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCDO00767 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCDO00767 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCDO00767 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCDO00767 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCDO00767 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCDO00767 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCDO00767 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCDO00767 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCDO00767 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCDO00767 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCDO00767 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCDO00767 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCDO00767 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCDO00767 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCDO00767 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCDO00767 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCDO00767 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCDO00767 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCDO00767 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCDO00767 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCDO00767 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCDO00767 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCDO00767 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCDO00767 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCDO00767 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCDO00767 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCDO00767 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCDO00767 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCDO00767 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCDO00767 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCDO00767 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCDO00767 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCDO00767 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCDO00767 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCDO00767 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCDO00767 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCDO00767 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCDO00767 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCDO00767 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCDO00767 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCDO00767 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCDO00767 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCDO00767 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCDO00767 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCDO00767 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCDO00767 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCDO00767 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCDO00767 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCDO00767 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCDO00767 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCDO00767 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCDO00767 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCDO00767 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCDO00767 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCDO00767 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCDO00767 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCDO00767 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCDO00767 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCDO00767 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCDO00767 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCDO00767 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCDO00767 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCDO00767 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCDO00767 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCDO00767 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCDO00767 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCDO00767 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCDO00767 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCDO00767 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCDO00767 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCDO00767 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCDO00767 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCDO00767 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCDO00767 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCDO00767 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCDO00767 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCDO00767 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCDO00767 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCDO00767 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCDO00767 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCDO00767 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCDO00767 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCDO00767 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms