Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STX16-NPEPL1H3BU86 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STX16-NPEPL1H3BU86 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX16-NPEPL1H3BU86 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms