Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA8SH3BPF8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA8SH3BPF8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA8SH3BPF8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA8SH3BPF8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA8SH3BPF8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA8SH3BPF8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA8SH3BPF8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA8SH3BPF8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA8SH3BPF8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA8SH3BPF8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA8SH3BPF8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA8SH3BPF8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA8SH3BPF8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA8SH3BPF8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA8SH3BPF8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA8SH3BPF8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA8SH3BPF8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA8SH3BPF8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA8SH3BPF8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA8SH3BPF8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA8SH3BPF8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA8SH3BPF8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA8SH3BPF8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA8SH3BPF8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms