Protein–RNA interactions for Protein: H3BNX3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNX3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BNX3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BNX3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BNX3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BNX3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BNX3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BNX3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BNX3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
H3BNX3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
H3BNX3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BNX3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BNX3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BNX3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BNX3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BNX3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BNX3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BNX3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BNX3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BNX3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BNX3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BNX3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BNX3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BNX3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BNX3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BNX3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BNX3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BNX3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BNX3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BNX3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BNX3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BNX3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BNX3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BNX3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BNX3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BNX3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BNX3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BNX3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BNX3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BNX3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BNX3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BNX3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BNX3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BNX3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BNX3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BNX3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BNX3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BNX3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BNX3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BNX3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BNX3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BNX3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BNX3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BNX3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BNX3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BNX3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BNX3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BNX3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
H3BNX3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BNX3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BNX3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BNX3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BNX3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BNX3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BNX3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BNX3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BNX3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BNX3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BNX3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BNX3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BNX3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BNX3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BNX3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BNX3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BNX3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BNX3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BNX3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BNX3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BNX3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BNX3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BNX3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BNX3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BNX3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BNX3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BNX3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3BNX3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BNX3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BNX3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BNX3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H3BNX3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BNX3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BNX3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BNX3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BNX3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BNX3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3BNX3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNX3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNX3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNX3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNX3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3BNX3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms