Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227AF5H4B4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM227AF5H4B4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM227AF5H4B4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms