Protein–RNA interactions for Protein: E9PIF3

NPIPA2, Nuclear pore complex-interacting protein family member A2, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA2E9PIF3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPA2E9PIF3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPA2E9PIF3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPIPA2E9PIF3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPA2E9PIF3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms