Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E9PBE3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E9PBE3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E9PBE3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E9PBE3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E9PBE3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E9PBE3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
E9PBE3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E9PBE3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PBE3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
E9PBE3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E9PBE3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E9PBE3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E9PBE3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
E9PBE3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E9PBE3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
E9PBE3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E9PBE3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E9PBE3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PBE3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PBE3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PBE3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PBE3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PBE3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E9PBE3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PBE3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PBE3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E9PBE3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E9PBE3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E9PBE3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
E9PBE3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E9PBE3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E9PBE3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E9PBE3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
E9PBE3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E9PBE3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
E9PBE3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PBE3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PBE3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PBE3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PBE3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PBE3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PBE3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PBE3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E9PBE3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E9PBE3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
E9PBE3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E9PBE3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E9PBE3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E9PBE3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E9PBE3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E9PBE3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E9PBE3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E9PBE3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E9PBE3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E9PBE3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E9PBE3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E9PBE3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E9PBE3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E9PBE3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E9PBE3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E9PBE3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
E9PBE3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
E9PBE3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
E9PBE3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E9PBE3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E9PBE3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E9PBE3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
E9PBE3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E9PBE3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PBE3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PBE3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E9PBE3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PBE3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PBE3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E9PBE3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E9PBE3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E9PBE3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E9PBE3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E9PBE3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E9PBE3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E9PBE3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E9PBE3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E9PBE3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E9PBE3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E9PBE3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E9PBE3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E9PBE3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E9PBE3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E9PBE3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E9PBE3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E9PBE3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E9PBE3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E9PBE3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E9PBE3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PBE3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PBE3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PBE3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PBE3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E9PBE3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms