Protein–RNA interactions for Protein: C9IYK1

Gap junction protein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9IYK1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9IYK1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9IYK1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9IYK1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9IYK1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
C9IYK1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9IYK1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9IYK1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C9IYK1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
C9IYK1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C9IYK1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C9IYK1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C9IYK1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
C9IYK1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C9IYK1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C9IYK1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C9IYK1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C9IYK1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C9IYK1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C9IYK1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C9IYK1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9IYK1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9IYK1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9IYK1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C9IYK1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C9IYK1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
C9IYK1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
C9IYK1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C9IYK1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C9IYK1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
C9IYK1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9IYK1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C9IYK1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
C9IYK1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
C9IYK1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C9IYK1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9IYK1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9IYK1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9IYK1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9IYK1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9IYK1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9IYK1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9IYK1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9IYK1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9IYK1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C9IYK1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C9IYK1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C9IYK1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C9IYK1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C9IYK1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C9IYK1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C9IYK1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C9IYK1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C9IYK1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
C9IYK1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C9IYK1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C9IYK1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C9IYK1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C9IYK1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C9IYK1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C9IYK1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C9IYK1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C9IYK1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C9IYK1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C9IYK1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C9IYK1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C9IYK1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C9IYK1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C9IYK1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9IYK1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9IYK1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9IYK1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9IYK1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9IYK1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C9IYK1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C9IYK1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C9IYK1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C9IYK1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
C9IYK1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
C9IYK1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C9IYK1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
C9IYK1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C9IYK1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C9IYK1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C9IYK1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C9IYK1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C9IYK1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C9IYK1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C9IYK1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C9IYK1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C9IYK1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C9IYK1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C9IYK1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C9IYK1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C9IYK1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C9IYK1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C9IYK1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C9IYK1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C9IYK1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C9IYK1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms