Protein–RNA interactions for Protein: B6A8C7

TARM1, T-cell-interacting, activating receptor on myeloid cells protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARM1B6A8C7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TARM1B6A8C7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TARM1B6A8C7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TARM1B6A8C7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TARM1B6A8C7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TARM1B6A8C7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TARM1B6A8C7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TARM1B6A8C7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TARM1B6A8C7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TARM1B6A8C7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TARM1B6A8C7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TARM1B6A8C7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TARM1B6A8C7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TARM1B6A8C7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TARM1B6A8C7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TARM1B6A8C7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TARM1B6A8C7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TARM1B6A8C7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TARM1B6A8C7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TARM1B6A8C7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TARM1B6A8C7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TARM1B6A8C7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TARM1B6A8C7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TARM1B6A8C7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TARM1B6A8C7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TARM1B6A8C7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TARM1B6A8C7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms