Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF879B4DU55 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF879B4DU55 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms