Protein–RNA interactions for Protein: B1ANY3

FAM220BP, Putative protein FAM220BP, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220BPB1ANY3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM220BPB1ANY3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM220BPB1ANY3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM220BPB1ANY3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM220BPB1ANY3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM220BPB1ANY3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM220BPB1ANY3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM220BPB1ANY3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM220BPB1ANY3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM220BPB1ANY3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM220BPB1ANY3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM220BPB1ANY3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM220BPB1ANY3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM220BPB1ANY3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM220BPB1ANY3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM220BPB1ANY3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM220BPB1ANY3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM220BPB1ANY3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM220BPB1ANY3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM220BPB1ANY3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM220BPB1ANY3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM220BPB1ANY3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM220BPB1ANY3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM220BPB1ANY3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM220BPB1ANY3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM220BPB1ANY3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM220BPB1ANY3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM220BPB1ANY3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM220BPB1ANY3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM220BPB1ANY3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM220BPB1ANY3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM220BPB1ANY3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM220BPB1ANY3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM220BPB1ANY3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms