Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RGPD3A6NKT7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RGPD3A6NKT7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RGPD3A6NKT7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RGPD3A6NKT7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RGPD3A6NKT7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RGPD3A6NKT7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RGPD3A6NKT7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RGPD3A6NKT7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RGPD3A6NKT7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RGPD3A6NKT7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RGPD3A6NKT7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RGPD3A6NKT7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RGPD3A6NKT7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RGPD3A6NKT7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RGPD3A6NKT7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RGPD3A6NKT7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RGPD3A6NKT7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RGPD3A6NKT7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RGPD3A6NKT7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RGPD3A6NKT7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
RGPD3A6NKT7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
RGPD3A6NKT7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RGPD3A6NKT7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RGPD3A6NKT7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RGPD3A6NKT7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RGPD3A6NKT7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RGPD3A6NKT7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RGPD3A6NKT7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RGPD3A6NKT7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RGPD3A6NKT7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RGPD3A6NKT7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RGPD3A6NKT7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
RGPD3A6NKT7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RGPD3A6NKT7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RGPD3A6NKT7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RGPD3A6NKT7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RGPD3A6NKT7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
RGPD3A6NKT7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RGPD3A6NKT7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RGPD3A6NKT7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RGPD3A6NKT7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
RGPD3A6NKT7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
RGPD3A6NKT7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RGPD3A6NKT7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RGPD3A6NKT7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RGPD3A6NKT7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RGPD3A6NKT7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms