Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD8B2A6NJW9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD8B2A6NJW9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CD8B2A6NJW9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms