Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GOLGA6BA6NDN3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLGA6BA6NDN3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLGA6BA6NDN3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GOLGA6BA6NDN3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA6BA6NDN3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms