Protein–RNA interactions for Protein: A0A576

TCRBV9S1A1T, T-cell receptor beta variable 3-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV9S1A1TA0A576 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCRBV9S1A1TA0A576 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCRBV9S1A1TA0A576 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCRBV9S1A1TA0A576 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCRBV9S1A1TA0A576 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCRBV9S1A1TA0A576 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TCRBV9S1A1TA0A576 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCRBV9S1A1TA0A576 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCRBV9S1A1TA0A576 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCRBV9S1A1TA0A576 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCRBV9S1A1TA0A576 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCRBV9S1A1TA0A576 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCRBV9S1A1TA0A576 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCRBV9S1A1TA0A576 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCRBV9S1A1TA0A576 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCRBV9S1A1TA0A576 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCRBV9S1A1TA0A576 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCRBV9S1A1TA0A576 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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