Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms