Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUDCQ9Y266 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUDCQ9Y266 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms