Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms