Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms