Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNRC6CQ9HCJ0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNRC6CQ9HCJ0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms