Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TDRD3Q9H7E2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD3Q9H7E2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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