Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms