Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD5Q99717 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAD5Q99717 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms