Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSRNP1Q96S65 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSRNP1Q96S65 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms