Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HHIPQ96QV1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms