Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNAQ96QF7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms